sopot sanatorium bitwy pod płowcami

Wykazujemy, że BATF jest niezbędny do produkcji IL-9 zarówno w ludzkich jak i mysich komórkach Th9 i że współpracuje z IRF4 w wiązaniu i aktywacji locus Il9. Zdolność BATF do aktywacji genów Th9 odpowiada wymaganiu BATF w komórkach T do promowania alergicznego stanu zapalnego i zwiększonej zdolności komórek wykazujących ekspresję BATF do promowania alergicznego zapalenia. Zatem BATF jest kluczowym komponentem sieci czynników transkrypcyjnych indukujących fenotyp komórki Th9. Wyniki Komórki Th9 mają wyraźną sygnaturę transkrypcyjną. Komórki Th9 są wyspecjalizowane w produkcji IL-9. Nie jest jednak jasne, czy stanowią one całkowicie odrębny fenotyp komórki. Zdolność TGF. do konwersji Th2 na komórki Th9 sugerują, że te typy komórek mogą być podzbiorami tej samej linii. Aby zacząć definiować tożsamość komórek Th9, przeprowadziliśmy analizę mikromacierzy porównującą komórki Th9 (zróżnicowane z IL-4 i TGFa) z komórkami Th2 (zróżnicowanymi tylko z IL-4) i indukowalnymi komórkami Treg (zróżnicowanymi tylko z TGFa) (Dodatkowa ryc. 1A, materiał uzupełniający dostępny online w tym artykule; doi: 10.1172 / JCI69489DS1). Analiza skupień wykazała, że komórki Th2 i Th9 były bardziej podobne niż komórki Th9 i indukowalne Treg (iTreg) (rysunek 1A). Jednak, pomimo wyprowadzenia po stymulacji kombinacją cytokin, które oddzielnie promują różnicowanie Th2 lub Treg, komórki Th9 mają sygnaturę genu, która jest odmienna od każdego z podzbiorów. Figura Analiza mikronasieciowa sygnatury transkrypcyjnej Th9. Naiwne limfocyty T CD4 + różnicowano w warunkach polaryzacji Th2, Th9 lub iTreg przez 5 dni przed wyizolowaniem RNA do analizy mikromacierzy. (A) Porównanie rozkładu poziomów transkryptu w komórkach Th2, Th9 i iTreg. Hierarchiczne grupowanie przeprowadzono przy użyciu korelacji Pearsona z oprogramowaniem MeV. (B) Graficzne przedstawienie 629 genów, które były wzbogacone w komórki Th9 co najmniej 2-krotnie w porównaniu z komórkami Th2 lub iTreg. Geny zostały podzielone jako wzbogacone w komórki Th9 5-krotnie (oznaczone jako> J) lub wzbogacone 2- do 5-krotnie (oznaczone jako>> A) w porównaniu z innymi podzbiorami Th. (C) Mapa termiczna wybranych genów w komórkach Th9, Th2 i iTreg. Geny wybrano w oparciu o funkcje, które obejmują czynniki transkrypcyjne, cytokiny i receptory powierzchniowe. Clustering przeprowadzono przy użyciu analizy odległości Manhattan. Aby dokładniej zbadać sygnaturę genu Th9, zdefiniowaliśmy podgrupę genów między komórkami Th2, Th9 i Treg, które były co najmniej 2-krotnie wzbogacone w podzbiorze Th9 w porównaniu z pozostałymi dwoma podzbiorami. Znaleźliśmy 629 genów wzbogaconych w podzbiór Th9 (rysunek 1B i tabela dodatkowa 1). Z tego podzbioru genów 208 wykazało 5-krotne lub większe wzbogacenie w porównaniu z komórkami Th2 lub iTreg (Figura 1B i Tabela Uzupełniająca 1). Wspólną tożsamość komórek Th9 z komórkami Th2 i iTreg zaobserwowano również w tym podgrupie genów. Było 207 genów, które były ponad 5-krotnie bardziej wzbogacone w komórki Th9 niż w Tregach, ale były one tylko 2- do 5-krotnie bardziej wzbogacone niż komórki Th2 (Figura 1B i Tabela Uzupełniająca 1). Odwrotnie, było 30 genów, które ulegały ekspresji w komórkach Th9, które wykazywały 5-krotnie większą ekspresję niż w komórkach Th2, ale wykazywały jedynie 2- do 5-krotnie większą ekspresję niż w komórkach iTreg (Figura 1B). Aby porównać ekspresję genów w wyższej rozdzielczości, wygenerowaliśmy mapę cieplną skupiającą się na czynnikach transkrypcyjnych, cytokinach i receptorach powierzchniowych wyrażanych w komórkach Th9. Spośród tego podzbioru genów podobnie obserwowaliśmy komórki Th2 i Th9 skupione ściślej niż podzestawy na komórki Treg (ryc. 1C). Porównaliśmy także zmiany w ekspresji genów pomiędzy odpoczynkowymi komórkami Th9 i komórkami Th9 aktywowanymi za pomocą anty-CD3 przez 6 godzin
[podobne: pszeniczny brzuch, katalog oriflame 2015, reumatoidalne zapalenie stawów leczenie ]